什么是R CMD Sweave myfile.rnw的等价物？
R CMD Sweave myfile.rnw等效命令行knitr是什么？
一般的解决scheme（适用于R版本）：
Rscript -e "library(knitr); knit('myfile.Rmd')"
从R 3.1.0开始， R CMD Sweave已经开始支持非Sweave文档（尽pipe命令名听起来有些奇怪），唯一需要做的就是在文档中指定一个vignette引擎，例如
%\VignetteEngine{knitr::knitr}
要在knitr中查看可能的小插曲引擎，请使用
library(knitr) library(tools) names(vignetteEngine(package = 'knitr')) # "knitr::rmarkdown" "knitr::knitr" "knitr::docco_classic" "knitr::docco_linear"
我有一个knitme.R脚本：
library(knitr) render_html() source("hooks.R") # mods to defaults inFile = commandArgs(trailingOnly=TRUE)[1] outFile = commandArgs(trailingOnly=TRUE)[2] knit(inFile,output=outFile)
所以我可以这样做
Rscript knitme.R $SOURCE $TARGET
$SOURCE和$TARGET是根据需要而定的。
你也可以把它融入Make ，所以你有一个规则，你所要做的就是：
make myfile.html
它会去myfile.Rhtml并生成HTML文件。 调整从.Rnw制作PDF
我使用的是SCons而不是Make，所以我有一个Sconscript文件， 这个文件有点复杂（部分原因是我刚刚开始学习使用SCons，所以它可能有点笨拙）
env=Environment() bld = Builder(action = '/usr/bin/Rscript knitme.R $SOURCE $TARGET', suffix='.html', src_suffix='Rhtml') env.Append(BUILDERS = {'Knit' : bld}) env.Knit(source='test.Rhtml',target='test.html')
那么我需要做的是：
scons test.html
如果test.Rhtml发生了变化，我会从test.Rhtml构buildtest.html 。
这是一个Sconstruct文件的一部分，它构build了一个完整的Web站点，并根据各种其他依赖项将其复制到一个服务器上。
现在漂stream题外话…
要添加到其他答案，如果你想编织/渲染文件，并在一行中打开输出，你可以使用：
Rscript -e "rmarkdown::render('file.Rmd')" & open file.pdf
我宁愿把它全部放在一行中，因为作为可重用的Vim命令运行起来更简单。
如果你想使用你的系统的非默认值，你也可以用特定的应用程序来replaceopen 。 我倾向于使用这个，如果我在Windows上，并希望使用苏门答腊来覆盖当前打开的PDF输出（所以我不必记得每次closures它）。
R CMD knit file.Rmd
是直接等价于R CMD Sweave file.Rmd
最近，在这种肮脏的工作中，还有增强的function。 对于幻灯片，我一直使用Rmarkdown YAML头来指定预期的输出格式，命令行是基本的，比如
R -e "library(rmarkdown); render(\"file.Rmd\")"
