使用R解压缩gz文件

我过去使用了?unzip来获取使用R的压缩文件的内容。这一次，我很难从一个.gz文件中提取文件，可以在这里find。

我已经尝试了?gzfile和?gzcon但一直没有得到它的工作。 任何帮助，您可以提供将不胜感激。

Answer 1

如果你真的想解压缩文件，只需使用支持gzip的untar函数。 例如：

 untar('chadwick-0.5.3.tar.gz') 

Answer 2

这里有一个可以帮助说明gzfile()和gzcon()

 R> foo <- data.frame(a=LETTERS[1:3], b=rnorm(3)) R> foo ab 1 A 0.586882 2 B 0.218608 3 C 1.290776 R> write.table(foo, file="/tmp/foo.csv") R> system("gzip /tmp/foo.csv") # being very explicit 

现在，该文件被写入，而不是隐式使用file() ，使用gzfile() ：

 R> read.table(gzfile("/tmp/foo.csv.gz")) ab 1 A 0.586882 2 B 0.218608 3 C 1.290776 R> 

你指出的文件是一个压缩的tar档案，据我所知，R本身没有接口tar档案。 这些通常用于分发源代码 – 例如R包和R源。

Answer 3

为了在R中解开文件，你可以这样做

 library(R.utils) gunzip("file.gz") 

Answer 4

http://blog.revolutionanalytics.com/2009/12/r-tip-save-time-and-space-by-compressing-data-files.html

R为最新版本（2.10）中的某些压缩文件添加了透明解压缩。 如果用bzip2，xvz或gzip压缩文件，则可以将它们读入R，就像它们是纯文本文件一样。 你应该有适当的文件扩展名。

命令…

 myData <- read.table('myFile.gz') 

#gzip压缩文件具有“gz”扩展名

将工作就像“myFile.gz”是原始文本文件。